Шинжлэх Ухаан Технологийн Сан
Нэвтрэх
  • Эхлэл /
  • Судалгаа боловсруулалтын тухай мэдээлэл

Хорт хавдар үүсгэгч болон дэлгэрүүлэгч генүүдийн сүлжээг илрүүлэх оптимизацид суурилсан аргуудын судалгаа



Салбар : Анагаах ухаан, эрүүл мэндийн шинжлэх ухаан

Төслийн дугаар :

Төслийн төрөл : Дээд боловсролын шинэчлэлийн төсөл

Хугацаа: 2015-2016

Санхүүжилт: 28000.00 мян.төг

Түлхүүр үг : Хавдрын үед идэвхжидэг генийн сүлжээ, гүдгэр оптимизацийн бодлого, граф хайлтын аргууд, статистик граф үнэлгээний аргууд, хавдар үүсгэгч генетик өөрчлөлт, мутац.

Үр дүн

Олон улсын хуралд илтгэл: Төслийн үр дүнгүүдээр олон улсын эрдэм шинжилгээний хуралд 4 илтгэл хэлэлцүүлсэн.
Олон улсын сэтгүүлд өгүүлэл: 1 өгүүлэл олон улсын SCI ангилалд багтах Applied Mathematical Modelling сэтгүүлд илгээгээсэн.
Хөгжүүлсэн программ хангамж: Төслийн хүрээнд дэвшүүлсэн аргачлалыг ашиглах программ хангамж болон бэлтгэгдсэн өгөгдлүүдийг http://gcancer.org/KPOCN/ гэсэн хаягаар интернэтэд байршуулсан.

Удирдагч

Амгалан овогтой Баярбаатар

bayarbaatar@seas.num.edu.mn


Эрдэм шинжилгээний бүтээл
1. Нэг сэдэвт бүтээл, ном, товхимол /нэр/

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
2. Эрдмийн зэрэг горилсон бүтээлийн нэр

3. Шинэ ба шинэчилсэн бүтээгдэхүүний загвар

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
1 Хөгжүүлсэн программ хангамж: Төслийн хүрээнд дэвшүүлсэн аргачлалыг ашиглах программ хангамж болон бэлтгэгдсэн өгөгдлүүдийг http://gcancer.org/KPOCN/ гэсэн хаягаар интернэтэд байрлуулж гадаад дотоодын судлаачид авч ашиглах боломжыг бүрдүүлсэн Дэлгэрэнгүй
4. Шинэ болон шинэчилсэн технологи /нэр/

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
5. Тоног төхөөрөмжийн туршилтын загвар

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
6. Батлагдсан стандарт

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
7. Зөвлөмж

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
8. Заавар

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
1 Интернетэд http://gcancer.org/KPOCN/ хаяган дээр KPOKN аргыг ашиглан тооцоолол хийх зааварыг англи хэл дээр бэлдэж байршуулсан Дэлгэрэнгүй
9. Патент

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
10.Ашигтай загварын гэрчилгээ


№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
11.Зохиогчийн эрхийн гэрчилгээ


№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
12. Техник эдийн засгийн үндэслэл

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
13. Газрын зураг, атлас

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
14. Шинэ онол, теором

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
15. Эрдэм шинжилгээний өгүүлэл гадаад

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
1 An Integrative Model for Identification of Key Players of the Cancer Network гэсэн гарчигтай өгүүлэл олон улсын SCI ангилалд багтах Applied Mathematical Modelling сэтгүүлд Bayarbaatar Amgalan, Ider Tseveendorj, Hyunju Lee гэсэн зохиогчуудтайгаар илгээгээд байна. Дэлгэрэнгүй
16. Эрдэм шинжилгээний өгүүлэл дотоод

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
17.Эрдэм шинжилгээний илтгэл гадаад

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
1 Илтгэлийн сэдэв:1. Identification of key players on cancer-activated multi-dimensional network. Илтгэгч: А.Баярбаатар Илтгэлийн сэдэв:2. Partial Correlation Based Graph Estimation on Gene Expression Profile. Илтгэгч: Г.Махгал Илтгэлийн сэдэв:3. Interior Ball Method for Piecewise Convex Maximization Problems. Илтгэгч: Ц.Идэр Хурал Дэлгэрэнгүй
2 Хавдар үүсгэгч дэлгэрүүлэгч генийн сүлжээг илрүүлэх аргыг хөхний хавдрын бодит өгөгдөл дээр туршсан үр дүнг Program Gaspard Monge Program for Optimization and Operation Research, Paris, France (PGMO Days https://www.fondation-hadamard.fr/fr/pgmo/pgmodays) олон улсын эрдэм шинжилгээний хуралд 1 аман илтгэл хэлэлцүүлсэн Илтгэлийн сэдэв: An integrated method for uncovering key effects on cancer-activated multi-dimensional network. Илтгэгч: А.Баярбаатар 2016 Дэлгэрэнгүй
18.Эрдэм шинжилгээний илтгэл дотоод

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
19.Аргачлал

№ Зохиогч Бүтээлийн нэр Он
1 Энэхүү судалгааны хүрээнд математик загварчлал ашиглан хавдартай болон эрүүл эсийн генийн мэдээллүүд дээр анализ хийж хавдар үүсэх болон дэлгэрэхэд үндсэн шалтгаан болж буй генетик өөрчлөлтийг илэрүүлэх шинэ арга, KPOCN (Key Players of Cancer Network)-ыг дэвшүүлсэн. KPOCN арга нь статистик үнэлгээний аргуудыг гүдгэр болон глобал оптимизацийн аргуудтай хослуулан хүний генийн тоон өгөгдөл дээр анализ хийхэд ашиглагдана. Дэлгэрэнгүй
20.Ишлэл

1.Zhang S, Liu CC, Li W, Shen H, Laird PW, Zhou XJ. Discovery of multi-dimensional modules by integrative analysis of cancer genomic data. Nucleic Acids Research. 2012 Oct;40(19): 9379-9391.
2.Akavia UD, Litvin O, Kim J, et al. An integrated approach to uncover drivers of cancer. Cell. 2010 Dec;143(6): 1005-1017.
3.Amgalan B, Lee H. WMAXC: A Weighted Maximum Clique Method for Identifying Condition-Specific Sub-Network. PLoS ONE. 2014 Aug;9(8): e104993.
4.Amgalan B, Lee H. DEOD: uncovering dominant effects of cancer-driver genes based on a partial covariance selection method. Bioinformatics. 2015 Aug;31(15):2452-2460.
5.Perron, O. Zur theorie der matrices. Mathematische Annalen. 1907 Apr;64(2):248-263.
6.MacCluer, Charles R. The many proofs and applications of Perron's theorem. Siam Review. 2000 Jun 42(3):487-498.
7.Carla D, Uri DA, Francesco N, et al. RHPN2 Drives Mesenchymal Transformation in Malignant Glioma by Triggering RhoA Activation. Cancer Research. 2013 Aug;73(16): 5140-5150.
8.Mahesar AW, Waqas A, Mehmood N, Shah A, Wahiddin MR. Analyzing the weighted dark networks using scale-free network approach. WSEAS Transactionson computers. 2015 14(1): 748-759.
9. Fox WP, Everton SF. Using mathematical models in decision making methodologies to find key nodes in the Noordin dark network. American Journal of Operations Research. 2014 Jul 4(4): 255-267
10.Ашигласан өгөгдлийн сангууд
•Gene Ontology Consortium, Биологийн процессуудын генийн мэдээллийн өгөгдлийн сан http://www.geneontology.org/
•DAVID Bioinformatics Resources 6.8, Биологийн молекулуудын харилцан үйлчлэлүүдийн замуудын мэдээллийн өгөгдлийн сан https://david.ncifcrf.gov/
•The Cancer Genome Atlas, Хавдрын генийн мэдээлэл агуулсан хамгийн том баталгаат өгөгдлийн сан https://cancergenome.nih.gov/

Сэтгэгдэл бичих
Нэр :

СЭТГЭГДЛҮҮД