Нэгдүгээрт бүлэгт инновацийн мөн чанар, инновацийн чадавхийн тухай ойлголт, үндэсний инновацийн тогтолцоон дахь их сургуулийн гүйцэтгэх үүрэг, их сургуулийн хөгжлийн чиг хандлагыг авч үзэв. Түүнчлэн байгууллага, тэр дундаа их сургуулийн инновацийн чадавхийг тодорхойлж, үнэлэх арга зүйг судлан, аргачлал боловсруулав. Хоёрдугаар бүлэгт Монгол улсын шинжлэх ухаан, боловсролын салбарын өнөөгийн байдалд, төрийн өмчийн 6 их сургуулийн инновацийн нөөц, чадавхийн судалгааг хийж, үр дүнг гаргасан болно. Гуравдугаар бүлэг их сургуулиудын инновацийн чадавхийг дээшлүүлэх арга засыг тодорхойлж, санал болгосон ба инновацийн чадавхийг үнэлэх аргачлалыг хэрэглэх талаар санал зөвлөмж дэвшүүлэв.